人类利用乌贼进行科学研究的方法主要包括以下几个方面：

1. 实验模型：乌贼的生物学特性，如喷墨防御、变色能力、高速游泳等，使其成为科学研究的理想实验模型。科学家可以通过对乌贼的行为、生理和遗传特征的研究，揭示生物适应环境变化的机理，为生物技术和工程应用提供灵感。

2. 解剖学研究：乌贼的身体结构和神经系统具有一定的代表性，科学家通过对其进行解剖学研究，可以深入了解其生物学特性，为比较生物学和进化生物学的研究提供重要数据。

3. 基因工程：科学家可以通过基因工程技术研究乌贼的基因组，了解其生物学特性的遗传基础。例如，研究乌贼的喷墨防御机制，可以为生物技术的应用提供新的思路。

4. 生态学研究：通过对乌贼的种群分布、数量变动、食物链关系等进行研究，可以了解海洋生态系统的结构和功能，为海洋资源管理和生态保护提供科学依据。

5. 深海生物学研究：乌贼在深海环境中具有很强的适应性，科学家通过对深海乌贼的研究，可以揭示深海生物的生存策略和适应机制，为深海生物学和地质学的研究提供重要信息。

6. 药物开发：乌贼的墨汁具有抗菌和抗炎作用，科学家可以通过研究乌贼的墨汁成分，开发新型药物和治疗手段。

总之，人类通过多种途径利用乌贼进行科学研究，这些研究不仅有助于揭示生物适应环境变化的机理，为生物技术和工程应用提供灵感，还有助于了解海洋生态系统的结构和功能，为海洋资源管理和生态保护提供科学依据。